por Juanjo LunaPredecir poses con DiffDock
Te ayuda a predecir cómo encaja una pequeña molécula en una proteína con DiffDock-L. Sirve para obtener poses 3D ordenadas de un ligando sin definir una caja de búsqueda previa.
Descripción original (inglés)
diffdock: Predict small-molecule binding poses with DiffDock-L (Corso et al. 2023/2024, github.com/gcorso/DiffDock) — blind diffusion docking that places a ligand into a protein pocket without a predefined search box and ranks the samples with a learned confidence model. Reach for this skill to dock a SMILES or SDF against a PDB, to generate ranked 3D poses for a small fragment library, or to get a starting pose for downstream rescoring. DiffDock predicts geometry, not affinity.
Cómo instalarla
Una skill es una carpeta con un fichero SKILL.md. Para instalarla basta con copiar la carpeta diffdock en el sitio donde tu agente busca sus skills.
- Sin terminal: abre la carpeta en GitHub, descárgala y cópiala en la carpeta de tu agente (tabla de abajo).
- Con terminal (macOS, Linux o Git Bash en Windows): elige tu agente y copia los comandos.
git clone --depth 1 https://github.com/aipoch/open-science.git /tmp/skill-src
mkdir -p ~/.claude/skills
cp -r "/tmp/skill-src/resources/skills/diffdock" ~/.claude/skills/diffdock
rm -rf /tmp/skill-src| Agente | Para todos tus proyectos | Solo un proyecto |
|---|---|---|
| Claude Code | ~/.claude/skills | .claude/skills |
| GitHub Copilot | ~/.copilot/skills | .github/skills |
| Codex | ~/.agents/skills | .agents/skills |
| Gemini CLI | ~/.gemini/skills | .gemini/skills |
Muchos agentes leen también .agents/skills. Reinicia el agente después de instalar. Antes de instalar una skill, revisa su SKILL.md y los scripts que incluya: se ejecutan con tus permisos.
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Explicación redactada con ayuda de IA a partir de la descripción original.