Inferir redes reguladoras génicas
Te ayuda a encontrar posibles relaciones entre factores de transcripción y genes a partir de datos de expresión. Sirve para inferir redes reguladoras en datos bulk o de célula única.
Descripción original (inglés)
arboreto: Infers candidate gene regulatory networks from bulk or single-cell expression data using AertsLab Arboreto GRNBoost2 and GENIE3. Use for transcription factor-target association ranking, compatible Dask execution, sparse expression inputs, and network stability checks.
Cómo instalarla
Una skill es una carpeta con un fichero SKILL.md. Para instalarla basta con copiar la carpeta arboreto en el sitio donde tu agente busca sus skills.
- Sin terminal: abre la carpeta en GitHub, descárgala y cópiala en la carpeta de tu agente (tabla de abajo).
- Con terminal (macOS, Linux o Git Bash en Windows): elige tu agente y copia los comandos.
git clone --depth 1 https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git /tmp/skill-src
mkdir -p ~/.claude/skills
cp -r "/tmp/skill-src/skills/arboreto" ~/.claude/skills/arboreto
rm -rf /tmp/skill-src| Agente | Para todos tus proyectos | Solo un proyecto |
|---|---|---|
| Claude Code | ~/.claude/skills | .claude/skills |
| GitHub Copilot | ~/.copilot/skills | .github/skills |
| Codex | ~/.agents/skills | .agents/skills |
| Gemini CLI | ~/.gemini/skills | .gemini/skills |
Muchos agentes leen también .agents/skills. Reinicia el agente después de instalar. Antes de instalar una skill, revisa su SKILL.md y los scripts que incluya: se ejecutan con tus permisos.
Más skills de K-Dense-AI/scientific-agent-skills
- Fluxos metabólicos con 13C 13c-metabolic-flux
- Experimentos con Adaptyv Bio adaptyv
- Machine learning para series temporales aeon
- Interpretar variantes con AlphaGenome alphagenome
- Validación de métodos analíticos analytical-method-validation
- Trabajar con datos de célula única anndata
- Refinar hipótesis de investigación arbor
- Astronomía con Astropy astropy
Explicación redactada con ayuda de IA a partir de la descripción original.