Consultar datos de CELLxGENE
Te ayuda a buscar y extraer datos públicos de célula única y transcriptómica espacial en CELLxGENE Census. Sirve para consultar metadatos, expresión génica, atlas de referencia y datos a gran escala.
Descripción original (inglés)
cellxgene-census: Queries the CZ CELLxGENE Census programmatically for versioned public single-cell and spatial transcriptomics data. Use when you need population-scale cell metadata, gene expression slices, Census summary counts, source H5AD URIs/downloads, embeddings, spatial Census data, or reference atlas comparisons across organisms, tissues, diseases, assays, and cell types. For analyzing your own local single-cell data use scanpy, anndata, or scvi-tools.
Cómo instalarla
Una skill es una carpeta con un fichero SKILL.md. Para instalarla basta con copiar la carpeta cellxgene-census en el sitio donde tu agente busca sus skills.
- Sin terminal: abre la carpeta en GitHub, descárgala y cópiala en la carpeta de tu agente (tabla de abajo).
- Con terminal (macOS, Linux o Git Bash en Windows): elige tu agente y copia los comandos.
git clone --depth 1 https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git /tmp/skill-src
mkdir -p ~/.claude/skills
cp -r "/tmp/skill-src/skills/cellxgene-census" ~/.claude/skills/cellxgene-census
rm -rf /tmp/skill-src| Agente | Para todos tus proyectos | Solo un proyecto |
|---|---|---|
| Claude Code | ~/.claude/skills | .claude/skills |
| GitHub Copilot | ~/.copilot/skills | .github/skills |
| Codex | ~/.agents/skills | .agents/skills |
| Gemini CLI | ~/.gemini/skills | .gemini/skills |
Muchos agentes leen también .agents/skills. Reinicia el agente después de instalar. Antes de instalar una skill, revisa su SKILL.md y los scripts que incluya: se ejecutan con tus permisos.
Más skills de K-Dense-AI/scientific-agent-skills
- Fluxos metabólicos con 13C 13c-metabolic-flux
- Experimentos con Adaptyv Bio adaptyv
- Machine learning para series temporales aeon
- Interpretar variantes con AlphaGenome alphagenome
- Validación de métodos analíticos analytical-method-validation
- Trabajar con datos de célula única anndata
- Refinar hipótesis de investigación arbor
- Inferir redes reguladoras génicas arboreto
Explicación redactada con ayuda de IA a partir de la descripción original.