por Juanjo LunaGenerar transcriptómica espacial virtual
Te ayuda a predecir expresión génica espacial a partir de imágenes histológicas con DeepSpot-M. Sirve para estimar perfiles de transcriptómica espacial a partir de cortes teñidos con H&E.
Descripción original (inglés)
deepspot-m: Generates transcriptome-wide virtual spatial transcriptomics from H&E histology with DeepSpot-M. Used for predicted log1p-CPM expression from 224x224 tiles at about 20x, querying the released protein-coding gene panel by symbol, and whole-slide prediction after resolution-aware tiling with histolab.
Cómo instalarla
Una skill es una carpeta con un fichero SKILL.md. Para instalarla basta con copiar la carpeta deepspot-m en el sitio donde tu agente busca sus skills.
- Sin terminal: abre la carpeta en GitHub, descárgala y cópiala en la carpeta de tu agente (tabla de abajo).
- Con terminal (macOS, Linux o Git Bash en Windows): elige tu agente y copia los comandos.
git clone --depth 1 https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git /tmp/skill-src
mkdir -p ~/.claude/skills
cp -r "/tmp/skill-src/skills/deepspot-m" ~/.claude/skills/deepspot-m
rm -rf /tmp/skill-src| Agente | Para todos tus proyectos | Solo un proyecto |
|---|---|---|
| Claude Code | ~/.claude/skills | .claude/skills |
| GitHub Copilot | ~/.copilot/skills | .github/skills |
| Codex | ~/.agents/skills | .agents/skills |
| Gemini CLI | ~/.gemini/skills | .gemini/skills |
Muchos agentes leen también .agents/skills. Reinicia el agente después de instalar. Antes de instalar una skill, revisa su SKILL.md y los scripts que incluya: se ejecutan con tus permisos.
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Explicación redactada con ayuda de IA a partir de la descripción original.