por Juanjo LunaAnalizar datos de scRNA-seq con Scanpy
Te ayuda a hacer control de calidad, normalización, clustering y visualización de datos de RNA-seq de célula única con Scanpy. Sirve cuando trabajas con análisis exploratorio y quieres conservar la procedencia de los datos.
Descripción original (inglés)
scanpy: Performs Scanpy single-cell RNA-seq QC, normalization, HVG selection, PCA/UMAP/t-SNE, clustering, exploratory marker ranking, pseudobulk preparation, visualization, and Seurat or SingleCellExperiment RDS conversion to h5ad. Applies to established exploratory scRNA-seq workflows with explicit count and expression provenance; complementary skills cover scvi-tools models and AnnData format details.
Cómo instalarla
Una skill es una carpeta con un fichero SKILL.md. Para instalarla basta con copiar la carpeta scanpy en el sitio donde tu agente busca sus skills.
- Sin terminal: abre la carpeta en GitHub, descárgala y cópiala en la carpeta de tu agente (tabla de abajo).
- Con terminal (macOS, Linux o Git Bash en Windows): elige tu agente y copia los comandos.
git clone --depth 1 https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git /tmp/skill-src
mkdir -p ~/.claude/skills
cp -r "/tmp/skill-src/skills/scanpy" ~/.claude/skills/scanpy
rm -rf /tmp/skill-src| Agente | Para todos tus proyectos | Solo un proyecto |
|---|---|---|
| Claude Code | ~/.claude/skills | .claude/skills |
| GitHub Copilot | ~/.copilot/skills | .github/skills |
| Codex | ~/.agents/skills | .agents/skills |
| Gemini CLI | ~/.gemini/skills | .gemini/skills |
Muchos agentes leen también .agents/skills. Reinicia el agente después de instalar. Antes de instalar una skill, revisa su SKILL.md y los scripts que incluya: se ejecutan con tus permisos.
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Explicación redactada con ayuda de IA a partir de la descripción original.