por Juanjo LunaUsar herramientas bioinformáticas en Tamarind
Te ayuda a ejecutar en la nube herramientas de diseño molecular y biología estructural de Tamarind. Sirve para predecir estructuras, diseñar proteínas, hacer docking y analizar afinidad o dinámica molecular.
Descripción original (inglés)
tamarind: Provides access to a collection of open-source molecular design and structural biology tools on the Tamarind Bio platform, via its REST API or MCP server — no local GPUs required. Tamarind bundles popular open-source models for structure prediction (AlphaFold, Boltz, Chai, ESMFold), protein, binder, and de novo design (RFdiffusion, ProteinMPNN, BoltzGen), antibody and nanobody design and developability, protein-ligand docking (DiffDock, Autodock Vina), binding-affinity prediction, MSA generation, and molecular dynamics. Use when the user mentions Tamarind or tamarind.bio, wants to run any of these open-source tools in the cloud, references app.tamarind.bio/api or the x-api-key header, or needs to submit batches of sequences for structural or biophysical characterization.
Cómo instalarla
Una skill es una carpeta con un fichero SKILL.md. Para instalarla basta con copiar la carpeta tamarind en el sitio donde tu agente busca sus skills.
- Sin terminal: abre la carpeta en GitHub, descárgala y cópiala en la carpeta de tu agente (tabla de abajo).
- Con terminal (macOS, Linux o Git Bash en Windows): elige tu agente y copia los comandos.
git clone --depth 1 https://github.com/K-Dense-AI/scientific-agent-skills.git /tmp/skill-src
mkdir -p ~/.claude/skills
cp -r "/tmp/skill-src/skills/tamarind" ~/.claude/skills/tamarind
rm -rf /tmp/skill-src| Agente | Para todos tus proyectos | Solo un proyecto |
|---|---|---|
| Claude Code | ~/.claude/skills | .claude/skills |
| GitHub Copilot | ~/.copilot/skills | .github/skills |
| Codex | ~/.agents/skills | .agents/skills |
| Gemini CLI | ~/.gemini/skills | .gemini/skills |
Muchos agentes leen también .agents/skills. Reinicia el agente después de instalar. Antes de instalar una skill, revisa su SKILL.md y los scripts que incluya: se ejecutan con tus permisos.
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Explicación redactada con ayuda de IA a partir de la descripción original.